抄録
RG-003
タンパク質周囲の水分子の観測に基づいたリガンド結合部位予測システムの開発
◎佐々木孝章・関嶋政和（東工大）
タンパク質とリガンドの結合は，タンパク質の機能発現や創薬に重要である．タンパク質の大規模な構造解析により，多くのタンパク質の構造情報が得られてきており，タンパク質とリガンドとの結合を予測し，機能発現や創薬への応用が期待されている．従来，リガンド結合部位は立体構造解析と静電場の解析から求められてきており，その結果，in silico による創薬では相補的構造を有する分子を中心に探索されている．本研究では，水分子が自由度を得るとエントロピー的に有利に機能することを利用し，タンパク質周囲の水分子のダイナミクス解析を行うことでリガンドの結合部位予測を行うシステムを開発し，その検証を行った．