抄録
G-021
大規模ゲノム復元のためのde novoアセンブリアルゴリズムの開発
◎遠藤友基・外山　史・東海林健二・宮道壽一（宇都宮大）
次世代シーケンサの登場により，大量のDNA断片を短時間で得ることができるようになったため，巨大未知ゲノムの解読が期待されている．しかし，巨大な未知のゲノムの全塩基配列をde novoアセンブリソフトで決定する場合，大量のメモリを消費するためスーパーコンピュータを用いてもメモリ不足となる． そこで本研究では，次世代シーケンサから得られた大量のデータを用いて，大規模なゲノムに対してもアセンブリが可能となるように，消費メモリ量の少ないde novoアセンブリアルゴリズムを提案する．